此後兩百多年，荷蘭人和葡萄牙人圍繞帝汶島展開你來我往的爭奪，期間，英國還曾經短暫占據帝汶島，當然無論誰占領，帝汶島土著帝汶人都是被奴役的命運。1859年，荷蘭和葡萄牙達成協議，劃定勢力範圍，這一化界也就是東西帝汶今天的界線了。荷蘭占西部，葡萄牙占東部，就這樣，荷葡正式完成對帝汶島的瓜分。
而荷蘭不光占了西帝汶，還占了今天印尼境內的所有17000多個島嶼。二戰時，帝汶島落入日軍手中，此後又由澳大利亞管理，二戰後，荷蘭在東南亞的殖民地鬧起了獨立運動，荷蘭的這些殖民地，其實分屬不同民族，按道理，他們沒有成為一個國家的基礎，不過由於他們有一個共同的敵人荷蘭，使這些地區團結一致，最終形成了統一的印尼，當然，正是由於混亂的民族組成，印尼國內由此產生很多問題。作為印尼的殖民地，西帝汶自然成為獨立的印尼的一部分。而東帝汶，則重新由葡萄牙接管。
到70年代，東帝汶由於內部的政治分歧，分成三派，一派親葡，一派親印尼，還有一派主張獨立，並由此引發內戰，印尼則以此為由頭，於1975年出兵占領東帝汶，並宣布東帝汶成為印尼的一個省。此後的二十多年，在聯合國、葡萄牙、澳中等國的斡旋下，印尼最終在1999年同意東帝汶進行統一公投，當然，作為印尼固有領土一部分的西帝汶，自然不可能包含在內。就這樣，最終超過78%的公民贊成獨立，2002年5月20日正式建國。
回顧東帝汶乃至帝汶島的歷史，可謂是一把辛酸淚，先後被數個國家奴役壓迫，最終總算是成功建國了，但是，帝汶人和帝汶島則不得不面臨分裂，甚至可能是永久的分裂。這些和西方列強有莫大的關係。
值得一提的是，在東帝汶建國的過程中，澳大利亞一直是最出錢出力支持的國家，為什麼呢？澳大利亞最大的假想敵就是印尼，澳大利亞信奉天主教，而印尼90%是穆斯林，而印尼人口是澳大利亞的十倍。東帝汶恰好在澳大利亞和印尼之間，它的獨立對澳大利亞來說是個屏障。另外還有一個不得不提的國家就是中國，中國是最先與東帝汶建交的國家之一，中國與印尼的關係，相信不說大家也知道，只想說一點，印尼從18世紀開始，發生了數都數不清的排華、屠殺華人事件，其中許多是得到印尼當局的默許甚至是慫恿的。這樣一個國家，我們能喜歡嗎？
